Nuclear speckle protein SON safeguards efficient splicing of GC-rich genes
本研究は、核スプレイクに局在するタンパク質 SON が、U2 snRNP や SR タンパク質と協調して C 配列に富む弱いスプライス部位を安定化させることで、GC 配列に富む遺伝子の効率的なスプライシングを維持し、その進化的拡大を支えていることを明らかにしました。
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molecular biology
370 件の論文
ATM safeguards DNA replication at endogenous base lesions
本論文は、ATM 欠損細胞において酸化損傷による複製フォークの異常な再開始が DNA 欠損を生じさせ、これが PARP 阻害剤に対する合成致死性の主要なメカニズムであることを解明した。
FreeTrace enables fractional Brownian motion-based single-molecule tracking and robust anomalous diffusion analysis
この論文は、生細胞内の単一分子追跡においてブラウン運動の仮定に依存せず、分数ブラウン運動に基づいて軌道を再構築し、極めて短い軌跡からも拡散特性を高精度に推定できる新しいフレームワーク「FreeTrace」を開発し、生体内の異常拡散解析を革新したことを報告しています。
Pathogenic Leptospira in dogs and rodents in Tha Wang Pha, Thailand - Prevalence, diversity and linked environments
タイのナーン県における犬と小型哺乳類の調査により、病原性レプトスピラ属菌の感染実態と多様性が明らかになり、特にネズミから初めてL. weiliiが検出されたほか、犬が人獣共通感染症の橋渡し役となる可能性が示唆され、農村部での統合的なワンヘルス監視の重要性が強調されました。
Evaluating codon optimization strategies for mammalian glycoprotein production with an open-source expression vector
本研究では、開発したオープンソース発現ベクター「pTipi」を用いて哺乳類細胞におけるグリコタンパク質生産を評価した結果、一般的なコドン最適化はnative配列よりも優位ではなく、RNA 安定性を優先する戦略は発現を低下させるが、最も豊富なコドンを偏りさせて使用することは一部で有効であることが示されました。
PARG inhibition sequesters nuclear PAR-binding proteins, including XRCC1 and its partners, into nuclear condensates to elicit cytotoxicity
本論文は、PARG 阻害剤が核内凝縮体を形成させて XRCC1 などの PAR 結合タンパク質を隔離し、DNA 修復能力を阻害することで細胞毒性を発現するメカニズムを解明し、PAR 結合因子の欠損が PARG 阻害療法の予測バイオマーカーとなり得ることを示しています。
Study of the molecular nature of resistance to bifenazate in a Tetranychus urticae Koch Laboratory Strain
本論文は、ロシアのハダニ集団においてビフェナザート耐性が急速に固定されたことを示し、単一の G126S 変異が耐性獲得に十分であることを分子レベルで実証したものである。
HIV superinfection reveals sequential reservoir reactivation and immune-driven rebound dynamics
HIV 超感染の事例解析により、宿主の HLA 型に適応した超感染株が免疫制御を破綻させ、治療中断後に異なるウイルス系統が順次再活性化し、免疫圧によってエスケープ変異株が優位になるという複雑なリザーバー動態と再発メカニズムが明らかになりました。
Friedreich ataxia transcriptomic dysregulation and identification of cell type-specific biomarkers: A systematic review and meta-analysis
本論文は、ヒトの bulk RNA-seq データを統合したシステマティックレビューとメタ分析により、フリードライア型アタキシアにおける細胞タイプ特異的な転写異常と選択的脆弱性のメカニズムを解明し、MYH14、MEG9、MEG8 などの有望なバイオマーカーを同定するとともに、治療応答性を評価し、その結果を公開のインタラクティブ・アトラスとして提供したものである。
HCF1 orchestrates O-GlcNAcylation and affinity-dependent transcription through extended molecular determinants and register-shifted binding
この論文は、HCF1 の結合パートナーを網羅的にスクリーニングし、従来の知見を超えた結合決定因子やアフィニティ依存性の転写活性、ならびに O-GlcNAc 修飾の促進を明らかにすることで、HCF1 が転写と O-GlcNAc 化をどのように制御するかという分子機構を大幅に解明したものである。
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
本研究は、単一細胞 RNA シーケンシングを用いて、ダニ由来病原体 Ehrlichia muris eauclairensis 感染時の ISE6 細胞の転写応答を解析し、感染初期にストレス適応や代謝関連遺伝子の発現上昇、後期には細胞周期や DNA 複製関連遺伝子の広範な発現低下が時間依存的に起こることを明らかにし、この細胞系統がダニ病原体研究における有用な資源であることを再確認しました。
Damaging the conical morphology of HIV-1 capsid by targeting the FG-binding pocket and disfavoring pentameric subunits needed for core closure
本研究は、HIV-1 カプシドの FG 結合ポケットに結合する化合物 ZW-1261 が、五量体サブユニットの形成を阻害し、カプシドの閉鎖と構造完全性を損なう分子機構を解明したものである。
Systematic identification of tissue-conserved m6A sites reveals a stable epitranscriptomic regulatory layer controlling essential genes
この論文は、24 種類のヒト組織にわたって一貫して存在する 5,945 個の m6A 修飾部位（TC サイト）を同定し、これらが RBM15/B によって媒介され、細胞の恒常性維持に不可欠な遺伝子の安定した発現制御に関与していることを明らかにするとともに、がんにおけるこの安定したエピトランスクリプトーム層の破綻が転写変化に関与している可能性を示唆しています。
HDAC inhibitor treatment restores transcriptome, chromatin accessibility and memory deficits in a mouse model for Down syndrome
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤（SAHA）による治療は、ダウン症候群マウスモデルにおいて、ヒストンアセチル化の回復を通じて過剰な染色体のヘテロクロマチン化を誘導し、転写プロファイル、クロマチンアクセシビリティ、および記憶障害を包括的に改善することを示しました。
Structural basis of translation in transcription-translation coupling
本論文は、クライオ電子顕微鏡解析により、大腸菌における転写・翻訳複合体（TTC）が翻訳サイクルの各段階でリボソームの構造変化に応じてヌスGとヌスAの柔軟性を介して緩やかに結合した状態から密に結合した状態、そして衝突した状態へと順次変化し、最終的にリボソームの 30S ヘッドの回転が阻害されて転写終結を引き起こす構造基盤を解明したものである。
No phenotypes in Ttc22 knockout mice
TTC22 がヒト大腸腺腫瘍の転移に関与すると報告されていたにもかかわらず、CRISPR-Cas9 法で作製した Ttc22 ノックアウトマウスでは、発育、繁殖、自発的腫瘍発生、および化学誘発性大腸がんの発生に顕著な表現型の変化は見られなかった。
Loss of KMT2D accelerates hypertrophic chondrocyte differentiation and senescence by increasing mitochondrial ROS production
本研究は、KMT2D 欠乏が電子伝達系機能不全を介してミトコンドリア ROS 産生を増加させ、酸化ストレスを介して軟骨細胞の早期肥大化と老化を誘導することで、カブキ症候群 1 型における骨格異常の主要なメカニズムを解明したことを示しています。
A circRNA-based uricase replacement therapy for sustained treatment of hyperuricemia
本研究は、リポイドナノ粒子を介して投与された人工化ヒト型ウリカーゼを発現する環状 RNA（circRNA）が、高尿酸血症モデルマウスにおいて単回投与で急速かつ持続的に血清尿酸値を低下させ、腎障害を軽減する有望な治療戦略であることを示しました。
Fishing pressure induces changes in DNA methylation in genetically homogeneous marine metapopulations
この研究は、遺伝的に均一な海洋魚類集団において、漁業圧力が年齢の短縮とは独立して DNA メチル化パターンを変化させることを示し、漁業がエピジェネティックな変異を通じて局所適応を形成する可能性を初めて実証したものである。
Einstein from Noise: Statistical Analysis
本論文は、ノイズのみからテンプレート信号に類似した構造を誤って推定してしまう「Einstein from Noise」現象の統計的メカニズムを解明し、その推定量のフーリエ位相がテンプレートに収束することや収束速度の特性を数学的に証明することで、構造生物学や工学などの分野におけるテンプレートマッチング手法の潜在的な落とし穴を明らかにしています。